Polemik ini mencolok sejak Prof Yusuf mulai menyinggung nama AHY di laman twitternya. Dia menyebut AHY bodoh karena membahas soal kecelakaan pesawat Sriwijaya Air beberapa waktu lalu.
" YthKetua Umum @ PDemokrat, @AgusYudhoyono, @ProfYLH udah harus buktikan memang kau BODOH sekali, karena sepanjang sejarah jatuhnya pesawat di Indonesia tak pernah ada" GOVERNMENT ERROR "penyebabnya. Tapi" 7 FAKTOR "(http://indonesiabaik.id/infografis /7-faktor-penyebab-jatuhnya-pesawat).Maaf kau bodoh turunan, belajar lagi AHY!,” ujar Yusuf dalam cuitannya pada 12 Januari 2021 pagi.
Cuitan ini menuai perdebatan panjang. Termasuk menyulut komentar dari Marzuki Alie yang merupakan mantan Sekjen Demokrat. "Maaf prof, sy jg dosen, sy banyak teman2 rektor PTN n PTS, sy pernah ke USU kasih kuliah umum, bertemu mhsw yg demo soal UKT. Bahasa seorang pendidik harusnya bahasa akademik, bukan buzzer atau preman, anda mendidik anak2 calon pemimpin, bgmn kelakuan anak didik dg contoh spt ini," cuit Marzuki Alie membalas Yusuf.
Sebelumnya, Yusuf juga menyinggung ayah AHY yang merupakan Presiden Indonesia ke-6.
"Yth.@SBYudhoyono,tahu dirilah kau sudah mantan jadi jangan sok mengajari @jokowi soal pembangunan proyek strategis nasional,karena kau memang gagal&telah dijuluki:"Bapak Mangkrak Indonesia", jadi tak pantas kau ajari @jokowi "ikan berenang" karena pasti malu kalipun kau, paham!," cuit Yusuf pada Sabtu 9 Januari 2021.